Privalomos ir pasirenkamos priklausomybės¶

Šiame puslapyje aprašomos FrontISTR kompiliavimui reikalingos bibliotekos ir pasirenkamos bibliotekos, išplečiančios jo funkcijas. Kaip įdiegti kiekvieną biblioteką, žr. tos bibliotekos dokumentaciją.

Privalomos priklausomybės¶

FrontISTR kompiliavimui reikalingi šie įrankiai ir bibliotekos.

Biblioteka	Versijos reikalavimas	Paskirtis
CMake	≥ 3.13.4	Kompiliavimo sistema
C/C++/Fortran kompiliatorius	—	Pirminio kodo kompiliavimas
MPI	—	Lygiagrečiojo ryšio biblioteka (OpenMPI, IntelMPI ir kt.)

Pasirenkamos priklausomybės¶

Šios bibliotekos yra pasirenkamos ir gali būti įjungiamos kompiliavimo metu pagal reikalingas funkcijas. Atitinkamas CMake parinktis žr. Kompiliavimas su CMake.

Biblioteka	CMake parinktis	Paskirtis	Šaltinis
METIS (v4/v5)	`WITH_METIS`	Srities skaidymas grafų skaidymo metodu	Karypis Lab
MUMPS + ScaLAPACK	`WITH_MUMPS`	Lygiagretusis tiesioginis sprendiklis	MUMPS-Solver.org / Netlib
Intel oneAPI MKL	`WITH_MKL`	Tiesioginis sprendiklis (PARDISO), BLAS/LAPACK	Intel
OpenBLAS / LAPACK	`WITH_LAPACK`	Skaitinė tiesinė algebra (sąlygotumo skaičiaus įvertinimas)	OpenBLAS.net / Netlib
Trilinos ML	`WITH_ML`	AMG išankstinis sąlyginimas	Trilinos Project
REVOCAP_Refiner	`WITH_REFINER`	Tinklo tikslinimas	FrontISTR atsisiuntimo puslapis
REVOCAP_Coupler	`WITH_REVOCAP`	Susietoji analizė	FrontISTR atsisiuntimo puslapis
NetCDF	`WITH_NETCDF`	Išvestis Exodus II formatu	Unidata
Doxygen	`WITH_DOC`	API dokumentacijos generavimas	Doxygen.nl

Papildomi įrankiai GPU kompiliavimui¶

FrontISTR GPU spartinimas įgyvendintas naudojant OpenACC, o šiuo metu patikrintoje konfigūracijoje naudojamas NVIDIA HPC SDK. Be pirmiau išvardytų privalomų bibliotekų, GPU kompiliavimui reikalingi šie įrankiai.

Įrankis	Paskirtis	Šaltinis
NVIDIA HPC SDK (`nvc`, `nvc++`, `nvfortran`)	OpenACC skaičiavimų perkėlimo į GPU kompiliavimas	NVIDIA

Išsamiau apie GPU kompiliavimo procedūrą, įskaitant nepalaikomų bibliotekų tvarkymą, žr. GPU kompiliavimas.