Notkun Docker-myndarinnar¶
Með opinberu Docker-keyrslumyndinni er hægt að keyra FrontISTR án þess að setja upp háð söfn þess. Um uppsetningu Docker sjálfs skal vísa til skjölunar fyrir viðkomandi umhverfi.
Sækja myndina¶
Myndin inniheldur eftirfarandi söfn sem þarf við keyrslu.
- MPI: Open MPI
- METIS
- MUMPS
- Trilinos ML
- Intel MKL (x86_64-umhverfi)
Keyra greiningu¶
Keyrið greininguna með því að deila vinnumöppu hýsilsins, þar sem inntaksskrárnar eru, með gáminum. Notið -v til að deila möppunni og -w til að tilgreina vinnumöppuna.
docker run --rm -v $PWD:/work -w /work \
registry.gitlab.com/frontistr-commons/frontistr/fistr1:latest fistr1
Sjálfgefin skipun myndarinnar er fistr1 (heimild: docker/container/Dockerfile, CMD ["fistr1"]). Til að gefa valkosti, til dæmis til að athuga útgáfu, skal tilgreina skipunina á eftir heiti myndarinnar.
Um undirbúning inntaksskráa og ritun stýriskráa, sjá Greiningarflæði.
MPI-samhliða keyrsla¶
MPI-samhliða keyrsla fer fram með mpirun inni í gámnum. Fyrir nákvæmar keyrsluskipanir og ferli svæðaskiptingar, sjá Samhliða greining.